Salah satu Visi Program Studi Pendidikan IPA Universitas Trunojoyo Madura yaitu melakukan riset di bidang pendidikan IPA yang aplikatif untuk masyarakat. Oleh karena itu, untuk mendukung terlaksananya Visi tersebut, Program Studi Pendidikan IPA membentuk Tema Penelitian (TANEAN) yang terdiri atas Media dan Inovasi Pembelajaran IPA; Evaluasi Pembelajaran IPA; Kearifan Lokal dalam Pembelajaran IPA; serta IPA Terapan. Dari tema-tema tersebut kemudian dibuat menjadi sub-tema yang dapat dilihat pada Gambar berikut:
